Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms