Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP1-5Q9BYS1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP1-5Q9BYS1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms