Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms