Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms