Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTA3Q9BTC8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms