Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms