Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms