Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS8Q99627 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms