Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAP1L3Q99457 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms