Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBE2E3Q969T4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBE2E3Q969T4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBE2E3Q969T4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBE2E3Q969T4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBE2E3Q969T4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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UBE2E3Q969T4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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