Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms