Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms