Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms