Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf54Q8WWF1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms