Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 360.9 ms