Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FAM71DQ8N9W8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FAM71DQ8N9W8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FAM71DQ8N9W8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FAM71DQ8N9W8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM71DQ8N9W8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM71DQ8N9W8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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