Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF148Q8N7C7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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