Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms