Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM135Q86UB9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms