Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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