Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms