Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VSTM1Q6UX27 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms