Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC017007.2-201ENST00000504528 1301 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 MARK2P6-201ENST00000494974 897 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC245187.1-201ENST00000520162 559 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 VPS29-203ENST00000546588 1059 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC103739.2-201ENST00000559839 807 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC010531.3-201ENST00000569147 513 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 INTS6-AS1-204ENST00000593709 648 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 MFSD8-234ENST00000641503 1082 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CCDC144NL-AS1-216ENST00000582583 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms