Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 IRF5-201ENST00000249375 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms