Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RFTN2Q52LD8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms