Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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