Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms