Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms