Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms