Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLD3Q15054 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms