Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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NCAPHQ15003 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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NCAPHQ15003 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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NCAPHQ15003 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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