Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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