Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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