Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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