Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTK7Q13308 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms