Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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