Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms