Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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