Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
FOXI1Q12951 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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FOXI1Q12951 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
FOXI1Q12951 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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