Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms