Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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