Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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