Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CGNL1Q0VF96 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms