Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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