Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms