Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYP4F3Q08477 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms