Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms