Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
LRP1Q07954 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LRP1Q07954 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LRP1Q07954 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms