Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms