Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms